城乡卫生条件恶劣，导致各类传染病横行肆虐，群众在饱受战争的摧残下，又增添了病患的苦痛。黑热病是一种曾经流行于长江以北地区的传染病，淮海、盐阜两个地区是重流行区，村村有病人，死亡率极高。新四军第三师和当地政府一起，打响了防治黑热病的人民战争，广泛发动群众，宣传防病知识，开展卫生运动。三师医务人员冒着被传染的危险，迎着疫情逆行而上。在阜宁县小杨庄创办了黑热病专科休养所，由三师卫生部医务主任章央芬任所长。休养所成立后，大量收治黑热病病人，因病人太多，战士们自己盖的茅草房不够用，便借用当地群众的茅草房作为门诊室、手术室、药剂室和制剂室。到1945年12月，休养所共治愈黑热病病人1150人。有效遏止了黑热病的流传，得到了群众的衷心拥护。